Большой Заяцкий остров — один из шести крупных островов Соловецкого архипелага, находится в 5 км от Большого Соловецкого острова. Считается, что этимология названия связана с беломорскими нерпами, приплывающими на остров весной и которых местные жители называют морскими зайцами. Площадь острова составляет около 1,5 кв. км, но на этом небольшом клочке суши сконцентрировано большое количество уникальных памятников, относящихся к двум разным культурам — языческой и христианской. Это делает остров уникальным местом, где можно окунуться в многовековую историю Соловецкого архипелага.
Остров почти плоский, каменистый, на нем нет озер, болот и лесов; на продуваемой холодными морскими ветрами каменистой почве растут только травы, мхи и лишайники, встречаются кустарники и низкорослые деревья, в том числе кривоствольные «танцующие» березки. Ландшафт напоминает приполярную тундру.
Среди мхов и лишайников можно увидеть загадочные каменные лабиринты, созданные в II–I тысячелетиях до н. э., что говорит о том, что остров уже в глубокой древности был освоен человеком. Один из крупнейших в северной Европе комплексов лабиринтов включает девять древних лабиринтов, представляющих собой сооружения в виде составленных из небольших камней спиралей диаметром от 3 м и высотой 30–40 см, а также около 900 валунных сложений (насыпей-курганов и символических выкладок). Здесь находится один из самых больших в мире каменных лабиринтов — его диаметр более 25 м. Исследователи предлагают несколько версий назначения лабиринтов: они могли служить рыболовными ловушками, астрономическими календарями, астрономическими приборами или местами для проведения ритуалов и обрядов погребения. По мнению археологов, последний лабиринт был создан в XIV веке.
Большой Заяцкий остров издавна был своеобразными «морскими воротами» на Соловки. В середине XVI века, при игумене святителе Филиппе Колычеве, на острове были возведены и сохранились до наших дней валунные постройки: палата для проезжающих, поварня и гавань. Каменная гавань Большого Заяцкого острова с доками для стоянки и ремонта судов, в том числе иностранных, стала первой не только на архипелаге, но и в России.
В 1691 году на остров перенесена с Большого Соловецкого острова деревянная часовня, построенная в свое время стрельцами, осаждавшими монастырь во время известного «Соловецкого сидения». В 1702 году, когда Петр I во второй раз посетил Соловки, часовня была перестроена в церковь и в присутствии императора освящена во имя апостола Андрея Первозванного. По преданию, в церкви был освящен первый Андреевский флаг, ставший флагом Военно-Морского Флота Российской империи, и здесь же соловецкий настоятель архимандрит Фирс благословил императора Петра I на военный поход по «Государевой дороге» — Онежскому озеру и реке Свирь — к стенам шведской крепости Нотебург. Андреевская церковь, облик которой напоминает посадские церкви средней России и не характерен для Севера, является одним из древнейших памятников деревянного зодчества русского Севера и входит в ансамбль Свято-Андреевской пустыни.
В XVIII веке в Андреевской пустыни была устроена монастырская «таможня» для регулирования потока привезенного товара и проверки приходящих судов, чтобы они «не привезли чего недозволенного» (вина, табака) в монастырь и чтобы во время эпидемий на него не попадали заболевшие.
В 1854–1855 годах, во время Крымской войны, пустынь подверглась нападению со стороны английских судов, церковь была разграблена.
Во времена Соловецкого лагеря особого насечения на острове действовал штрафной изолятор для женщин.
С 1990 года, с момента возобновления на Соловках монашеской жизни, в Андреевском храме начались богослужения.
В храме апостола Андрея Первозванного восстановлен иконостас. Каждый год 13 июля, в праздник собора 12 апостолов, совершается Божественная литургия.
